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Sciences omiques appliquées à l'étude du vivant

  • Niveau d'étude

    Bac +4

  • ECTS

    3 crédits

  • Composante

    Sciences Fondamentales et Appliquées

  • Volume horaire

    25h

  • Période de l'année

    Semestre 1

Description

Cette UE vise à apporter aux étudiants des connaissances théoriques et pratiques quant à l’utilisation et l’exploitation des ressources omiques pour l’étude de questions biologiques spécifiques

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Objectifs

Ces enseignements permettront aux étudiants :
- de connaître les méthodes d’acquisition des données génomiques, transcriptomiques et protéomiques et leurs applications.
- d'apprendre à exploiter les bases de données inhérentes aux sciences omiques dans des cas d’études expérimentales ciblées.
- d'acquérir des connaissances approfondies sur l’organisation globale des génomes eucaryotes, l’organisation génique et la nature des séquences non codantes.

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Heures d'enseignement

  • Sciences omiques appliquées à l'étude du vivant - TPTP7h
  • Sciences omiques appliquées à l'étude du vivant - CMCM10h
  • Sciences omiques appliquées à l'étude du vivant - A-AMATPAtelier de méthodologie d'apprentissage - TP8h

Programme détaillé

Cours
Obtention des données génomiques par différentes approches. Du séquençage par la méthode de Sanger à la Next Generation Sequencing. Description et organisation des génomes eucaryotes modèles, évènements de polyploïdisation et notion de synthénie. Des puces à ADN au RNAseq, genotypage et profilage d’expression haut débit. Méthodes d’étude du protéome, échelle globale, quantification et identification de protéines.

TP
Ils seront abordés par la bio-informatique appliquée et complétés par des études de cas biologiques au laboratoire

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Compétences visées

Savoir utiliser les logiciels à l’interface entre les bases données omiques et leur exploitation. Etre capable de conduire une approche sur une question scientifique par l’utilisation des ressources omiques.

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