ECTS
Nombre d'heures
Niveau d'étude
Période de l'année
Cette UE permet d’appréhender les nouvelles approches en biologie utilisant des outils bio-informatiques.
Une partie des cours et des ateliers abordent les approches de génomique classique (séquençage), de génomique fonctionnelle incluant les nouveaux outils d’édition du génome (CRISPR Cas9), de transcriptomique et régulation de l’expression des gènes, la protéomique et métabolomique et leurs utilisations industrielles et fondamentales, illustrés sur des exemples pris dans le règne végétal (P Coutos-Thévenot).
Une autre couvre l’analyse de données avec une mise en pratique sur Galaxy (Ahmed Moussa, Brigitte Vannier).
Connaitre les principes des techniques Omics (NGS, Transcriptomique, protéomique).
Utiliser les outils web pour analyser visualiser et éditer le génome
Découvrir quelques plateformes couramment utilisées en Bioinformatique : GEO2R, Galaxy, Cytoscape
L3 Biologie
Liste matières
Liste obligatoire
Connaitre les approches globales en Biologie et avoir été initié à une ou des plateformes d’analyse.
Nouvelles approches en biologie utilisant des outils bio-informatiques.
Une partie des cours abordent les approches Omics sur des espèces végétales (P Coutos).
LES GRANDES APPLICATIONS DE LA GÉNOMIQUE VÉGÉTALE :
Une autre couvre l’analyse de données avec une mise en pratique sur Galaxy (Ahmed Moussa, Brigitte Vannier).
Une Analyse de données sera menée sur plusieurs séances par les étudiants en correspondance avec des tuteurs de l’ENSA de Tanger (Ahmed Moussa et Doctorants).
Méthode d'enseignement Hybride
Forme d'enseignement Total
Type d'enseignement